Under the doctrines of Quirk Doomsday Theory, the ideological group Humarise is convinced that all humans with quirks are diseased and must be eradicated. In order to rebuild the world, the group's extremists have constructed a lethal device known as a "Trigger Bomb" that causes people with quirks to lose control and die. Their leader, Flect Turn, evades capture from the Pro Heroes deployed around the world.

During his work study in the country of Otheon with Japan's number one Pro Hero, Izuku "Deku" Midoriya is accused of a crime he did not commit. Unintentionally involving Roddy Soul, a local, Deku soon finds himself on the run with the boy. It is now up to Rody, Deku, and Deku's classmates to stop the Trigger Bomb plot set in motion by Flect, all while eluding the other persistent members of Humarise.Di bawah doktrin Teori Kiamat Quirk, kelompok ideologis Humarise yakin bahwa semua manusia yang memiliki keanehan adalah sakit dan harus dibasmi. Untuk membangun kembali dunia, para ekstremis kelompok ini telah membuat alat mematikan yang dikenal sebagai “Bom Pemicu” yang menyebabkan orang-orang yang memiliki keanehan kehilangan kendali dan mati. Pemimpin mereka, Flect Turn, menghindari penangkapan dari Pahlawan Pro yang dikerahkan di seluruh dunia.

Selama masa studi kerjanya di negara Otheon bersama Pro Hero nomor satu di Jepang, Izuku “Deku” Midoriya dituduh melakukan kejahatan yang tidak ia lakukan. Tanpa sengaja melibatkan Roddy Soul, seorang penduduk setempat, Deku segera menemukan dirinya dalam pelarian bersama bocah itu. Sekarang tergantung pada Rody, Deku, dan teman-teman sekelas Deku untuk menghentikan plot Bom Pemicu yang digerakkan oleh Flect, sambil menghindari anggota Humarise yang gigih.