Setelah berakhirnya Perang Dunia Shinobi Keempat, Konohagakure telah menikmati masa-masa damai, kemakmuran, dan kemajuan teknologi yang luar biasa. Ini semua berkat upaya Pasukan Shinobi Sekutu dan Hokage Ketujuh desa, Naruto Uzumaki. Sekarang menyerupai kota metropolitan modern, Konohagakure telah berubah, terutama kehidupan shinobi. Di bawah pengawasan Naruto dan kawan-kawan lamanya, generasi baru shinobi telah melangkah maju untuk mempelajari cara-cara ninja.

Boruto Uzumaki sering menjadi pusat perhatian sebagai putra Hokage Ketujuh. Meskipun mewarisi sikap Naruto yang riuh dan keras kepala, Boruto dianggap sebagai anak ajaib dan mampu mengeluarkan potensinya dengan bantuan teman dan keluarga yang mendukung. Sayangnya, hal ini hanya memperburuk kesombongannya dan keinginannya untuk melampaui Naruto yang, bersama dengan gaya hidup ayahnya yang sibuk, telah merenggangkan hubungan mereka. Namun, kekuatan jahat yang muncul di dalam desa dapat mengancam kehidupan Boruto yang riang.

Teman-teman baru dan wajah-wajah yang tidak asing lagi bergabung dengan Boruto saat cerita baru dimulai.