Pencarian 100 Tahun: sebuah misi yang sangat menantang dan berbahaya sehingga belum terselesaikan selama lebih dari satu abad. Meskipun banyak sekali penyihir yang berusaha mencapai tujuan yang sangat melelahkan ini, hasil mereka berakhir dengan kekalahan telak atau lebih buruk lagi. Meskipun demikian, Natsu Dragneel dan teman-temannya—Lucy Heartfilia, Gray Fullbuster, Erza Scarlet, dan Wendy Marvell, serta Happy dan Charlés—dengan ambisius memulai misi tersebut.

Setahun setelah guild Fairy Tail mengalahkan kekuatan jahat Acnologia dan Zeref, Natsu dan timnya melakukan perjalanan ke benua utara Guiltina, di mana mereka mencari majikan dari Quest 100 Tahun dan menerima misi mereka yang hampir mustahil: menyegel diri Lima Dewa Naga—sekelompok individu dengan kekuatan besar yang, jika dibiarkan, dapat menyebabkan kehancuran global. Sementara itu, anggota baru yang penuh semangat bernama Touka direkrut ke Fairy Tail. Meskipun energinya yang bersemangat dan sifatnya yang penuh gairah menjadikannya sempurna untuk guild, tampaknya ada lebih dari yang terlihat dalam dirinya.

Bertekad untuk menyelesaikan misi mereka yang tampaknya tidak dapat diatasi, Natsu dan teman-temannya memulai pencarian berbahaya mereka untuk mencari Dewa Naga. Namun, setelah bertemu dengan guild gelap baru bernama Diabolos, dan rekrutan terbaru Fairy Tail mengungkapkan warna aslinya, Natsu dan timnya akan menyadari bahwa Quest 100 Tahun bukanlah satu-satunya tantangan yang mereka hadapi.