Berlatar belakang 23 tahun setelah akhir dari Future Card Buddyfight orisinil di mana putra dari Gao Mikado, Yuga Mikado menemukan Buddyfight untuk pertama kalinya. Ketika dia mulai memainkan game ini, dia membangkitkan nalurinya dan menjadi petarung yang luar biasa dalam waktu singkat. Perhatian ini membawa tantangan tersendiri dari saingan dan teman baru. Namun, ketenaran dan kegembiraan ini ada harganya.

Ini adalah generasi berikutnya dari Buddyfight!