Society for the Study of Modern Visual Culture, yang lebih dikenal sebagai Genshiken, kini dipimpin oleh Sasahara yang lebih percaya diri. Banyak hal telah berubah antara semester, dan klub otaku kini memiliki anggota baru yang membenci otaku bernama Ogiue. Tujuan awal Sasahara untuk mendirikan lingkaran doujin dan menjual majalah buatan penggemar tersebut di Festival Komik berikutnya menjadi kenyataan, tetapi kenyataan adalah tuan yang kejam… yang tampaknya melakukan crossplay. Setelah itu, klub dipenuhi dengan pembicaraan tentang hubungan Tanaka dan Ohno, yang mengambil langkah ragu-ragu ke depan.