Suatu hari, alien dari planet Pict melancarkan invasi dahsyat ke Bumi. Tujuan utama mereka adalah mengubah seluruh umat manusia menjadi “Noppera”—makhluk tanpa ciri khas dengan kulit putih polos, antena bercahaya, dan tanpa wajah. Hal ini mendorong negara-negara di dunia untuk melakukan serangan balik, tetapi mereka semua akhirnya dikalahkan, karena masing-masing melancarkan serangan secara terpisah.

Maka, baik negara Sekutu maupun Poros dari Hetalia: Axis Powers Movie: Paint it, White harus bersatu dan menyatukan kekuatan mereka untuk menghentikan invasi alien dan menyelamatkan planet mereka.