Takuya Arima adalah seorang siswa muda yang ayahnya, seorang sejarawan yang telah melakukan berbagai penelitian, menghilang baru-baru ini. Selama liburan musim panas, Takuya menerima sebuah paket aneh dari ayahnya yang hilang, bersama dengan sepucuk surat yang berisi informasi tentang keberadaan berbagai dunia paralel. Awalnya Takuya tidak menganggapnya serius, tetapi segera dia menyadari bahwa dia memiliki perangkat yang memungkinkannya melakukan perjalanan ke dimensi lain. Apakah ayahnya masih hidup? Jika ya, di manakah dia?