Sebuah kendaraan yang melarikan diri yang dikemudikan oleh Izumi Yasaka, dalam perjalanan menuju gedung Biro Keamanan Publik, dilaporkan sesaat sebelum menabrak gedung tersebut. Izumi adalah seorang konselor yang baru-baru ini melarikan diri ketika bekerja di fasilitas isolasi dan rehabilitasi kriminal laten yang dikenal sebagai Sanctuary.

Sebelum Inspektur Mika Shimotsuki dan Akane Tsunemori dapat menginterogasi tersangka, sebuah permintaan mendadak dikeluarkan dari fasilitas tersebut untuk segera membawa Izumi kembali. Ditafsirkan sebagai perintah langsung dari Kepala dan dewan di Sanctuary, para Inspektur mematuhinya, tetapi bersikeras agar Izumi diantar kembali secara pribadi. Tsunemori berniat untuk menyelidiki lebih lanjut dengan anggota tim lainnya di Biro.

Kini, Inspektur Shimotsuki akhirnya diberi kesempatan yang ditunggu-tunggunya-untuk menjadi penyelidik utama dalam sebuah kasus penting. Kasus ini mengikuti Shimotsuki dan tim Penegak Hukumnya saat mereka mengungkap rahasia Sanctuary.