Saat kisah Rozen Maiden berakhir, bab baru dimulai dalam Rozen Maiden: Träumend. Shinku dan boneka-boneka bernyawa lainnya dari koleksi Rozen Maiden menjalani kehidupan seperti biasa di rumah Jun Sakurada. Setelah menyesuaikan diri dengan perannya sebagai pasangan Shinku dalam permainan mematikan Alice Game, Jun mengatasi ketakutannya yang dulu dan bersiap untuk kembali ke sekolah. Meskipun Shinku dan boneka-boneka lain menghabiskan hari-hari dengan santai di kenyamanan rumah Jun, masa-masa gelap menanti di depan karena musuh baru muncul: Barasuishou, Rozen Maiden ketujuh.

Namun, Barasuishou adalah misteri bahkan bagi saudara-saudaranya, yang belum pernah melihatnya hingga saat ini. Shinku menganggap ini sebagai tanda bahwa Alice Game akan segera berakhir, artinya boneka-boneka tersebut akan segera dipaksa untuk bertarung satu sama lain. Dihantui oleh pertempuran yang akan datang dan mimpi buruk tentang boneka lain, Shinku mulai menjauh dari yang lain. Jika dia ingin meraih kemenangan, itu akan datang dengan harga yang tinggi—nyawa saudara-saudaranya.