Perang Suci, dari mitologi kuno, di mana Dewi Athena dan Hades telah bertempur satu sama lain saat mempertahankan bumi berulang kali selama kurun waktu 200 tahun. Kisah ini terjadi di Eropa abad ke-18, 243 tahun sebelum “Saint Seiya” yang asli. Tiga anak kecil, Tenma, Alone, dan Sasha telah berbagi masa kecil yang sangat bahagia bersama. Tenma yang cukup agresif namun terhormat telah pindah ke Sanctuary untuk menjadi orang suci. Di sanalah ia dipertemukan dengan Sasha yang merupakan saudara perempuan dari Alone dan mengetahui bahwa ia adalah reinkarnasi dari Dewi Athena. Alone yang baik hati, lembut dan suka melukis dipilih untuk menjadi jenazah musuh Raja Hades. Tenma akhirnya menjadi orang suci Pegasus dan terlibat dalam pertempuran sengit dengan sahabatnya Alone, Raja Hades. Pegasus Tenma, Raja Hades, dan Dewi Athena dan melalui putaran nasib mereka, ketiga nasib mereka bergabung bersama yang membuka prolog ke Saint Seiya yang asli.