Hibiki Tachibana telah mengalahkan banyak musuh yang kuat, menyelamatkan banyak nyawa tak berdosa, dan melarikan diri dari berbagai situasi yang menyedihkan, tetapi saat ini dia tidak dapat melarikan diri dari situasi yang paling menyedihkan, yaitu pekerjaan rumah musim panas! Meskipun kehidupan SMA-nya relatif biasa-biasa saja, karirnya sebagai anggota organisasi militer S.O.N.G. tidak seperti itu. Dengan menggunakan baju besi kuno yang kuat yang dikenal sebagai Symphogear, Hibiki dan rekan-rekan satu timnya bekerja sama dengan Perserikatan Bangsa-Bangsa untuk menangani perselisihan dan bencana internasional.

Selama pengarahan misi di markas besar, Hibiki diberitahu tentang organisasi misterius yang dikenal sebagai Bavarian Illuminati, yang bertanggung jawab atas beberapa bencana besar di masa lalu dan saat ini beroperasi di negara yang dilanda perang, Val Verde. Bersama-sama, Hibiki dan timnya menyusup ke salah satu pabrik Illuminati Bavaria dan membebaskan ratusan budak. Setelah terungkap, para alkemis Saint-Germain, Cagliostro, dan Prelati mengungkapkan diri mereka sebagai petinggi organisasi tersebut, dan-menggunakan kekuatan alkimia-mengumumkan revolusi global sembari mengorbankan ribuan nyawa. Dihadapkan dengan ancaman lain terhadap kelangsungan hidup dunia, Hibiki dan sekutunya harus menghadapi Illuminati Bavaria dalam pertempuran yang paling sulit dan merusak.