Setelah menangkis ancaman invasi Neuroi ke Romagna dan menghancurkan sarang musuh di Venezia, Yoshika Miyafuji kembali ke kampung halamannya di Kekaisaran Fusou. Meskipun kehilangan kemampuan sihir dan penyembuhannya, mantan perwira 501 Joint Fighter Wing ini ingin terus belajar kedokteran. Hal ini untuk membantu mereka yang membutuhkan, baik warga sipil maupun mereka yang berada di garis depan. Dia menerima undangan dari sekolah bergengsi di Eropa dan memutuskan untuk menerima tawaran tersebut, memulai perjalanan kembali ke benua yang dilanda perang.

Namun, bahaya baru muncul, karena semakin banyak Neuroi yang berhasil menerobos garis pertahanan manusia, muncul tanpa disadari di daerah yang seharusnya aman dan mengganggu keseimbangan kekuatan di Eropa. Rasa tanggung jawab Yoshika bertabrakan dengan ketidakmampuannya mengemudikan Unit Striker, tetapi dengan teman-temannya yang berada dalam bahaya, tampaknya hanya ada satu hal yang dapat dia lakukan.