Setelah latihan pengakuan cinta Natsuki Enomoto dengan Yuu Setoguchi, adik-adik mereka, Kotarou dan Hina, berjuang untuk menyatakan cinta mereka sendiri. Meskipun pertemuan pertama di sekolah menengah pertama dengan kakak kelasnya, Koyuki Ayase, merupakan pertemuan yang tidak menyenangkan, hati Hina terpikat oleh senyumnya yang hangat. Awalnya bingung dengan perasaan yang baru ditemukan ini, Hina segera menyadari bahwa dia telah jatuh cinta untuk pertama kalinya.

Mengejar kakaknya Yuu dan Koyuki yang ditaksirnya, Hina juga mendaftar di SMA Sakuragaoka; tetapi benang-benang cinta itu menjangkau jauh, dan menjerat Hina dan teman-temannya. Riuh namun sensitif, Hina berharap dapat menyatakan perasaannya kepada Koyuki yang berhati lembut. Sementara itu, Kotarou, yang tidak menyadari perasaannya sendiri terhadap Hina, bertekad untuk selalu membuat Hina tersenyum.

Suki ni Naru Sono Shunkan wo ..: Kokuhaku Jikkou linkai mengisahkan Hina, Kotarou, dan Koyuki di sekolah menengah. Cinta masa muda mereka menempa hubungan baru, tetapi juga mengancam untuk menghancurkan yang lain.