Meskipun ceria dan lembut, Sakura Sakurakouji adalah seorang seniman bela diri yang terampil dengan rasa keadilan yang tidak pernah goyah-apa pun situasinya. Setelah menyaksikan orang-orang terbakar dalam api biru saat dalam perjalanan pulang ke rumah, dia menelepon polisi untuk membawa pembunuhnya ke pengadilan, namun ternyata tidak ada bukti yang tersisa. Namun, semua keraguannya tentang apa yang dilihatnya lenyap ketika keesokan harinya, siswa pindahan baru, Rei Oogami, bergabung dengan kelasnya; dia adalah anak laki-laki yang dia lihat melakukan pembunuhan dengan darah dingin.

Rei baik hati, manis, dan dengan cepat menjadi populer, bertentangan dengan tuduhan Sakura. Tak lama kemudian, dia mengetahui sifat aslinya: seorang Pemecah Kode, atau “orang yang tidak ada.” Yang mengejutkan Sakura, Rei-bersenjatakan kekuatan misterius-berusaha menegakkan keadilan sesuai dengan prinsip “mata dibalas mata”. Bertekad untuk membawa Rei ke jalan yang benar, Sakura terus mendekatinya dengan harapan dapat menebusnya dari jalannya sebelum orang lain terluka.