Di kota kecil yang tenang bernama Sakuranomori, sekelompok teman muda akan mengucapkan selamat tinggal kepada salah satu di antara mereka. Karena rencana bisnis orang tuanya, Sana Hidaka harus pindah dari rumah masa kecilnya yang tenang ke kota ramai Tokyo. Meskipun hatinya sedih, ia harus mengucapkan selamat tinggal kepada teman-teman tercintanya—Aoi Oribe yang baik hati, kembar Wakatsuki yang penuh semangat, Shuri dan Shuusuke, serta Nanaka Yatsushiro yang ceria dan optimis. Namun, meskipun ia enggan meninggalkan mereka, ia percaya bahwa meskipun mereka terpisah jauh, mereka akan selalu menghargai kenangan persahabatan mereka.

Lima tahun kemudian, Sana, kini seorang siswa SMA berusia 16 tahun, kembali ke kampung halamannya dengan harapan dapat mengembalikan kehidupan lamanya. Namun, ia segera menyadari bahwa meskipun kotanya mungkin tidak berubah drastis, teman-teman yang ia tinggalkan bukanlah orang yang sama seperti dulu. Bayangan mengganggu melayang di atas Sakuranomori saat teman-temannya menyimpan rahasia baru dan memikul beban yang mengancam ikatan yang pernah mereka bagikan.