Persiapan untuk serangan baru melawan Neuroi – ras misterius penyerbu alien – sedang berlangsung. Tujuannya adalah mengamankan Berlin, ibu kota Kekaisaran Karlsland, yang diperlukan untuk memusnahkan ancaman Neuroi dari Eropa. Namun, karena musuh mampu beradaptasi di medan perang setiap hari, pasukan sekutu dan kondisi teknologi Striker saat ini mungkin tidak cukup untuk mencapai kemenangan.

Sementara itu, Yoshika Miyafuji, seorang Penyihir dari Fuso, melanjutkan studi medisnya di Lausanne. Setelah pulih dari insiden baru-baru ini yang membuatnya kehilangan kekuatan sihir, dia sangat ingin membantu dalam upaya perang. Panggilan untuk mengangkat senjata segera tiba dan para penyihir yang tersebar di 501th Joint Fighter Wing harus dikumpulkan sekali lagi untuk melakukan serangan terakhir melawan musuh.