Dunia Auldrant dikendalikan oleh Score, serangkaian ramalan dari abad-abad lalu yang menentukan masa depan dunia. Hal ini dianggap sebagai takdir mutlak yang diikuti oleh semua orang—bahkan mereka yang perbuatannya menyebabkan pertumpahan darah dan air mata. Menggunakan kemampuan magis yang dikenal sebagai Fonic Arts, perang antara negara Kimlasca-Lanvaldear dan Kekaisaran Malkuth dilancarkan dengan harapan mewujudkan utopia yang diramalkan oleh Score.

Tales of the Abyss mengikuti Luke von Fabre, yang menghabiskan hari-harinya terkunci di kediamannya setelah diculik dan kehilangan ingatannya saat masih anak-anak. Suatu hari, saat mengasah kemampuannya dalam pedang, seorang wanita bernama Tear mencoba membunuh tuannya. Luke melindunginya, tetapi pertarungan tersebut mengakibatkan keduanya terlempar ke tanah yang jauh. Perjalanan Luke dan Tear untuk kembali dengan cepat berubah menjadi petualangan yang akan menentukan apakah dunia akan terbebas dari belenggu Skor atau hancur sepenuhnya.